Mutations cachées de la tomate - comment l'avons-nous changé?

Les tomates ont beaucoup changé au fil des siècles. Il s'avère que nous les avons adaptés à nos besoins! Comment ont-ils muté? Voir par vous-même.

La tomate a un ADN complètement différent - après des siècles de culture, autrefois une baie sud-américaine de la taille d'un pois, elle prend maintenant toutes sortes de formes et de tailles.

Nous avons des tomates jaunes et rouges, du buffle, des framboises, des tomates cocktail et bien d'autres. Et les scientifiques se demandent comment ces changements physiques se manifestent au niveau des gènes. Et ces gènes pourraient être encore meilleurs, dit un document de recherche qui peut aider à stimuler les efforts d'amélioration de la tomate.

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L'auteur de l'ouvrage est Zachary Lippman de l'Institut médical Howard Hughes. Lui et ses collègues ont identifié des mutations longtemps cachées dans les génomes de 100 types de tomates, y compris celles cultivées à l'état sauvage dans les îles Galapagos et des variétés généralement transformées en ketchup et en sauce.

Leur analyse, rapportée le 17 juin 2020 dans la revue Cell, est l'évaluation la plus complète de ces mutations. Mutations qui modifient de longues étendues d'ADN dans chaque plante. La recherche pourrait conduire à la création de nouvelles variétés de tomates et à l'amélioration des variétés existantes, du moins disent les auteurs. Les scientifiques ont montré que plusieurs mutations identifiées par son équipe modifient des traits clés tels que le goût et le poids.

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Les mutations étudiées par l'équipe de Lippman sont beaucoup plus importantes - elles modifient la structure de l'ADN en copiant, en supprimant, en insérant ou en déplaçant de longs segments d'ADN ailleurs dans le génome. Ces mutations, également appelées variantes structurelles, se produisent partout dans le monde. Par exemple, des études sur l'homme ont lié ces différences à des troubles tels que la schizophrénie et l'autisme.

Les phytogénéticiens soupçonnent que ces mutations contribuent de manière significative aux caractéristiques des plantes et ont identifié plus de 200 000 mutations structurelles chez les tomates en utilisant une technique appelée séquençage à lecture longue!

200 mille mutation! C'est beaucoup, mais il faut savoir que la plupart des mutations trouvées ne changent pas les gènes qui codent pour le trait. Mais il est clair, dit Lippman, que bon nombre de ces mutations modifient les mécanismes qui contrôlent l'activité des gènes. Un de ces gènes, par exemple, contrôle la taille d'un fruit de tomate. En modifiant la structure de l'ADN - dans ce cas, le nombre de copies du gène - l'équipe de Lippman a pu modifier la production de fruits. Les plantes dépourvues du gène ne produisaient jamais de fruits, tandis que les plantes avec trois copies du gène produisaient des fruits qui étaient environ 30 pour cent plus gros que ceux avec une copie.

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